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中科院科学家构建空间转录组测序新方法【乐天堂fun88】

发布时间:2024-09-28 19:45人气:
本文摘要:中科院生物化学与细胞生物学研究所景乃禾课题组新近创办了一种技术方法,可以取得具备空间方位信息的少量细胞mRNA组图谱。

中科院生物化学与细胞生物学研究所景乃禾课题组新近创办了一种技术方法,可以取得具备空间方位信息的少量细胞mRNA组图谱。涉及研究成果日前在线公开发表于《大自然-实验室指南》。无论是体内的组织还是体外细胞系,有所不同细胞之间都不存在着差异性,即细胞的异质性。细胞的异质性对说明肿瘤的再次发生、干细胞或前体细胞的多能性与谱系分化、干细胞与微环境的相互作用等具备最重要意义。

近些年,单细胞测序技术很快发展,使得研究细胞之间的异质性沦为有可能。然而,目前单细胞测序的方法皆不会遗失细胞在体内原先的方位信息,而对某些研究领域如发育生物学、肿瘤生物学而言,细胞来源的方位信息是十分关键的。在景乃禾和彭广敦的指导下,陈军通过统合与优化单细胞测序和激光显微镜切割成技术,建构了一种需要取得少量细胞mRNA组信息,同时保有细胞原先方位信息的测序方法:Geo-seq。

Geo-seq是一种高效、高分辨率的空间mRNA组分析方案,既可用作mRNA图谱的三维重建,也可用作研究具备类似结构的少量的组织或细胞的mRNA组信息。利用Geo-seq技术,该课题组绘制了小鼠早期胚胎原肠运动中期细致的三维分子图谱,并说明了了小鼠细胞谱系蓝图创建过程中的空间mRNA组特征、mRNA因子和信号通路调控网络。据报,Geo-seq技术已顺利应用于小鼠大脑发育、肝脏肿瘤学以及人的精子发育等研究中。


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